V roku 1987 odkryl archeologický výskum vedený Michalom Slivkom a Františkom Javorským na Michalskom vrchu v Kežmarku zvyšky zaniknutého Kostola sv. Michala.
Pri archeologickom výskume v polohe Vojenské cvičisko pri ceste z Levoče do Spišskej Novej Vsi bol v roku 1978 odkrytý kostol, ktorého pôvod siaha možno ešte do 12. storočia.
V lete roku 1974 boli v katastri obce Budmerice, v polohe "Pieskovisko", odkryté zvyšky stredovekého kostolíka, ktorý podľa všetkého patril zaniknutej obci Fančal.
Počas výskumu románskogotického kostola v Seni v rokoch 2004 - 2005 boli pri severnej strane svätyne odkryté zvyšky pristavanej sakristie, ktorá mala netradičný pôdorys šesťbokej centrály.
Sondážny archeologický výskum v interiéri gotického Kostola sv. Martina v Hontianskej Vrbici v rokoch 2014 a 2015 zachytil murivo staršej románskej stavby.
Archeologický výskum gotického kostola v Kraskove v roku 1983 priniesol objav zvyškov staršieho chrámu, ktorý sa v odbornej literatúre datuje zvyčajne do obdobia 60. - 70. rokov 13. storočia.
V roku 2001 sa uskutočnil v areáli kostola vo Veľkých Zlievciach archeologický výskum, v rámci ktorého sa podarilo sčasti odkryť murivá zaniknutého stredovekého chrámu.
V prvej polovici 60. rokov 20. storočia objavil Bohuslav Chropovský pri výskume zaniknutého románskeho kostola na Martinskom vrchu zvyšky staršej predrománskej stavby.
V roku 1943 odkryl známy archeológ Vojtech Budinský-Krička severne od obce Osuské (okr. Senica) základy zaniknutého kostolíka patriaceho už neexistujúcej dedine Ropov. Dnes nie je objekt nijako prezentovaný.
