Minimálne do 15. storočia siaha pôvod stredovekého Kostola sv. Barbory v obci Sebedražie. Prestavby v 17. a 19. storočí do značnej miery potlačili jeho stredovekú podobu.
Až do roku 2000 stál v obci pôvodne gotický Kostol sv. Ondreja zo začiatku 15. storočia. Osud kostolíka sa naplnil 2001, kedy bol zbúraný a zachovala sa z neho len presunutá svätyňa.
Pri archeologickom výskume v polohe Vojenské cvičisko pri ceste z Levoče do Spišskej Novej Vsi bol v roku 1978 odkrytý kostol, ktorého pôvod siaha možno ešte do 12. storočia.
V roku 2002 zdokumentovali archeológovia v obci základy zaniknutého stredovekého kostola. Na jeho mieste postavili v 18. storočí nový chrám a v 21. storočí súčasný sakrálny objekt.
Kostol postavili v dominantnej polohe zrejme okolo roku 1300 ako stavbu kombinujúcu románske a gotické prvky. V období gotiky bol vyzdobený hodnotnými freskami.
Až do roku 1879 stál na okraji mesta gotický Kostol sv. Alžbety prestavaný na mestskú bránu. Po zbúraní pôvodnej lode bolo presbytérium upravené na kaplnku.