V roku 1972 objavila archeologička T. Nešporová pri výskume pod gotickým Barboriným palácom na Trenčianskom hrade zvyšky štvorapsidovej predrománskej rotundy.
Pri archeologickom výskume lokality Kostolisko pri Poltári v rokoch 1965 - 1966 boli odkryté okrem iného aj zvyšky opevneného stredovekého kostolíka datovaného do 2. polovice 13. storočia.
V roku 2004 pri románsko-gotickom Kostole sv. Juraja odkryl archeologický výskum iniciovaný nálezom ľudských kostí pri výstavbe rodinného domu murivo stavby identifikované ako gotický karner.
V roku 1987 odkryl archeologický výskum vedený Michalom Slivkom a Františkom Javorským na Michalskom vrchu v Kežmarku zvyšky zaniknutého Kostola sv. Michala.
Pri archeologickom výskume v polohe Vojenské cvičisko pri ceste z Levoče do Spišskej Novej Vsi bol v roku 1978 odkrytý kostol, ktorého pôvod siaha možno ešte do 12. storočia.